Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NCOA1Q15788 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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NCOA1Q15788 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NCOA1Q15788 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NCOA1Q15788 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NCOA1Q15788 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NCOA1Q15788 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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