Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SKIV2LQ15477 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SKIV2LQ15477 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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