Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
NKX1-1Q15270 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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