Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CKAP5Q14008 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms