Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CACNA1SQ13698 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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