Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HTR4Q13639 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms