Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PEX6Q13608 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms