Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SNTA1Q13424 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms