Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCGQ13326 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms