Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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TRAF3Q13114 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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TRAF3Q13114 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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TRAF3Q13114 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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TRAF3Q13114 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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TRAF3Q13114 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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TRAF3Q13114 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TRAF3Q13114 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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