Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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IFT88Q13099 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
IFT88Q13099 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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