Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SMARCB1Q12824 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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SMARCB1Q12824 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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SMARCB1Q12824 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SMARCB1Q12824 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SMARCB1Q12824 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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