Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP2P78314 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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