Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CRXO43186 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CRXO43186 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CRXO43186 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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