Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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