Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms