Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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USP18Q9UMW8 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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