Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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