Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NRF1Q16656 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms