Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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