Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
LAMA4Q16363 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA4Q16363 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms