Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
USF2Q15853 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
USF2Q15853 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USF2Q15853 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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