Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRADDQ15628 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms