Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SS18Q15532 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SS18Q15532 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SS18Q15532 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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