Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
GAPVD1Q14C86 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GAPVD1Q14C86 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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