Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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GPNMBQ14956 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GPNMBQ14956 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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