Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CDK13Q14004 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CDK13Q14004 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms