Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PKP1Q13835 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms