Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CACNA1SQ13698 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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