Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
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PKD2Q13563 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PKD2Q13563 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
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