Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PRPF4BQ13523 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PRPF4BQ13523 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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