Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SMAD4Q13485 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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