Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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