Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTGDRQ13258 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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