Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CALCOCO2Q13137 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms