Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms