Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 COA1-203ENST00000395879 2448 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SENP3Q9H4L4 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 IGHV3-75-201ENST00000523951 358 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SENP3Q9H4L4 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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