Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC9Q96Q05 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms