Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP53Q70EK8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP53Q70EK8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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