Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KNOP1Q1ED39 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KNOP1Q1ED39 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.9 ms