Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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