Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PCSK7Q16549 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms