Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SCARB2Q14108 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SCARB2Q14108 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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