Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NCOA4Q13772 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms