Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HDAC1Q13547 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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