Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRIM28Q13263 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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