Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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RPA4Q13156 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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RPA4Q13156 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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RPA4Q13156 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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RPA4Q13156 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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RPA4Q13156 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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