Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CHAF1BQ13112 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms