Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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GRIK3Q13003 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
GRIK3Q13003 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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