Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
BPTFQ12830 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms